EBYS yazılımlarını windowsa göre hazırladıkları için wine veya diğer araçlarla linuxta sorunsuz kullanılamaz. Aynı şey emniyetin yaptırdığı yazılımlarda da geçerli. Resmi kurumların bilgi işlem birimleri windowsa milyon dolar ödemeyi sevdikleri için yazılımlarını linux için geliştirmiyorlar.