Bir PPA deposundan uygulama kurduktan ya da güncelledikten sonra, ilgili PPA deposu Yazılım Kaynakları aracı veya başka bir şekilde kaldırılırsa; kurulan ya da güncellenen paketlere bir şey olmaz.
Bununla birlikte, bir PPA deposu ya da farklı bir depo sistemden kaldırılırsa; Yazılım Kaynakları aracının Bakım sekmesindeki "Dış paketleri sil" ya da "Dış paketlerin sürümünü düşür" seçenekleri ile, kurulan paketler kaldırılabilir ya da güncellenen paketlerin sürümü düşürülebilir. Eğer bu kısımlara dokunmazsanız bir şey olmaz. Deposu kaldırılan bir paket, paket yöneticisi tarafından dışarıdan elle kurulmuş gibi algılanır, tüm mesele bu.
Eğer bir PPA deposundan yazılım kurduğunuz ya da güncelledinizse, bu PPA deposunu pasifleştirmeminizi öneririm. Zira bu kaynaktan gelecek olası güncellemeleri de engellemiş olursunuz.