Depodan paket yönetimi ile kurulan/kurulmuş uygulamalar genellikle depoya yeni sürümleri eklenerek güncellenir. Yani depodan kurulmuş Thunderbird kendi kendine güncelleme almayacak, yeni sürüme yükseltme için depoya yeni sürümün eklenmesini beklemelisiniz.
Bununla birlikte Thunderbird uygulamasını sitesinden indirip de kullanabilirsiniz. İndirdiğiniz Thunderbird uygulamasının bulunduğu arşiv dosyasını çıkartın. Çıkarttığınız dizin içindeki thunderbird dosyasına çift tıklayarak uygulamayı çalıştırabilirsiniz. İsterseniz bu dosyayı çalıştıracağınız bir başlatıcı dosyası da hazırlayabilirsiniz. Bunun için Masaüstüne sağ tıklayıp, başlatıcı oluşturma seçeneğini kullanabilirsiniz. Ya da menü düzenleyici ile, menüye bir başlatıcı ekleyebilirsiniz. Bu şekilde sitesinden indirdiğiniz Thunderbird, paket yöneticisi yerine, Thunderbird uygulamasının sürüm güncelleme kanalından güncellenir. Not: Sitesinden indirdiğiniz sürümün güncelleme alabilmesi için, ev dizini içinde bir yerde konumlamanız gerekir. Kök dizin içinde erişim hakkı olmayan bir yere konumlarsanız, güncelleme kanalından güncelleme alamaz.