Sanırım disk seçiminde bir hata yapılmış, yoksa kurulum sırasında diğer disk bölümlerindeki verilerinize bir şey olmaması gerekir.
Böyle durumlarda veri kaybı yaşanan disk ya da disk bölümü üzerine herhangi bir veri yazılmamasına çok dikkat etmelisiniz. Mümkünse diski başka bir bir sisteme 2. disk olarak takıp dosya kurtarma işlemlerini misafir sistemde yapmayı deneyiniz. Böyle bir imkan yoksa veri kaybı yaşanan disk bölümünden başka bir bölüme verileri kurtarmayı planladığınız işletim sistemini kurmaya dikkat etmelisiniz.
Windows kuracağınız disk bölümü NTFS ya da Fat32 olarak biçimli olmalıdır. Biçimlendirme işlemini Gparted uygulaması ile yapabilirsiniz, kurulu değilse Yazılım Yöneticisinden aratıp kurmanız mümkündür. Daha fazla bilgiyi Windows ile alakalı forumdan edinebilirsiniz.