Çalıştırmaya çalıştığınız dosya .exe uzantılı ise aşağıdaki komutları sırasıyla uçbirimde çalıştırıp Wine uygulamasının son sürümünü kurunuz.
sudo add-apt-repository ppa:ubuntu-wine/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install wine1.7 winetricks
Sonra Java'nın Windows sürümünü sitesinden indirip, sağ tık wine ile çalıştıınız.
Eğer uygulama Java ile yazılmışsa, artık ilgili uygulamayı çalıştırabilmeniz gerekir.